「經派人到金門查證，烈嶼部隊打死越南難民，確有其事。由於旅營長對上隱瞞不報，防衛部亦未發覺；而事件發生於三月七日，十九條人命的處理，竟可隱瞞達兩個半月之久，事態嚴重。經詢蔣仲苓，亦不知情，余命其親往金門查處。」
八二三砲戰時，烈嶼地區的指揮官就是郝柏村本人，對於過去的防區——烈嶼——想必再熟悉也不過了。30年過去，聽聞部隊在自己年輕的駐防地闖下如此大禍，已經高升參謀總長的他，是以什麼樣的心情寫下日記。是震驚、氣憤，還是只是對下屬感到失望呢？
無論真實的心境如何，如此醜聞若被公諸於世，勢必嚴重破壞軍方與政府形象，甚至有可能害自己丟官，身為參謀總長，郝柏村要做的就是極力亡羊補牢，盡量將事件造成的傷害降到最低。
陸軍總司令蔣仲苓結束調查，郝柏村向總統報告完畢後。軍方內部決定開鍘，立即懲處相關人員，從金防部、烈嶼師部到旅、營級單位，一共拔掉了40多名軍官。5月28日，郝柏村詳細記下處分方式：
「金防部司令官趙萬富及政戰部主任張明宏調職⋯⋯一五八師（烈嶼師）師長龔力，該師政戰部主任及涉及濫殺之旅長、營長、連長，併交軍法偵辦。」
然而，疑似經退役返台的義務役官兵之口，外島軍隊誤殺難民的消息，依然在台灣傳了開來。紙畢竟包不住火，況且撤換金防部司令官，這等大事也不可能長期保密。烈嶼四維連的排長劉文孝，幾乎在當天就已經聽說師長和司令官，因為射殺難民的事情而被撤職了。
當下他還感到相當詫異，畢竟戰備規定寫的就是「強行登岸者格殺勿論」。若真要追究，守軍犯的錯誤也應該是，沒有及早發現目標，並且將其驅離，還讓該船靠岸，暴露了防線弱點。
視角回到台灣，當時成立不到一年的民進黨，獲悉外島軍隊誤殺難民後，剛當選立委的吳淑珍，立刻於6月5日在立法院發起質詢。然而，吳淑珍的質詢顯示，當時民間流傳的說法是：
「烈嶼守軍於五月底，意外讓一艘難民船靠岸，守軍開槍打死其中三個人後，才發現船上全是政府派駐在越南的地下工作人員。由於發現錯殺的是「國民黨自己人」，軍官擔心消息走漏，被秋後算帳，於是決定殺害剩下的人滅口。」
如同劉文孝排長的日記所述，在當年金門戰地的前線氛圍下，來路不明的船隻越界的情形經常發生，離岸過近的漁船被守軍擊沈的消息也時有耳聞，並沒有人會特別在意詳細情況。因此，要搞清特定案件的來龍去脈並不容易，外界自然也無法輕易掌握原貌。
外界傳聞與實際情形已有出入，在野黨也只能提出，金防部司令官被不尋常撤職作為證據。因此，即使輿論沸沸揚揚，軍方依然能四兩撥千斤的化解危機。國防部發言人張慧元當下否認謠言，僅說烈嶼守軍擊沈的是一艘越界的大陸漁船，並不是什麼「難民船」，上頭也沒有「自己人」。
直到多年後，郝柏村將自己擔任參謀總長時的日記公開出版，才證實1987年3月7日，烈嶼守軍打死的，確實是越南漁船上的難民，並不是來自大陸的「匪船」。然而，這艘船上的難民身份究竟為何，依然眾說紛紜。他們真的是越南人，還是如劉文孝排長聽人所說，是一艘載滿「越南華僑」的難民船？又或者，是不是真如吳淑珍的說法，船上是越戰後政府留在當地的政工人員，因走投無路而淪為難民呢？
這幾位難民是整起事件中，至今依然幽暗的一角，我們無從看清他們的身影和臉龐。他們究竟是誰、身份為何，我們或許無法得知這個問題的解答了。它已經伴隨3月7日的那幾聲槍響，永遠埋沒在烈嶼東崗的海灘上了。
